重慶醫科大學附屬兒童醫院于1956年由上海醫學院兒科系遷渝創建，是集醫教研為一體的國家三級甲等綜合性兒童醫院，最早被國家授予兒科學碩士、博士學位授予點、博士后流動站，是首批兒科學國家重點學科、教育部重點實驗室、國家級國際科技合作示范基地、國家級繼續醫學教育基地、國家級教學團隊、國家精品課程、國家食品藥品監督管理局藥物臨床試驗機構、全國住院醫師規范化培訓示范基地、國家級兒童早期發展示范基地、國家干細胞臨床研究備案機構、重慶市兒科臨床醫學研究中心；擁有重慶市重點實驗室3個和重慶市干細胞治療工程中心；先后獲得全國文明單位、全國“三八”紅旗單位、全國優秀衛生計生機構、全國衛生系統先進集體、全國精神文明建設工作先進單位、全國醫德建設先進單位，國家衛計委醫政醫管局2016年“改善醫療服務示范醫院”、國家衛計委“2015—2017年改善醫療服務先進典型”構建和諧關系示范醫院。在全國最佳醫院排行榜中位居全國兒童醫院第三位。

醫院現有教職員工3200余名，博士生導師26名、碩士生導師180名，高級職稱專家268名、享受政府特殊津貼專家14名。是中華醫學會兒科學分會、中華預防醫學會兒童保健分會、中國醫院協會兒童醫院管理分會副主任委員單位，是《中華兒科雜志》、《中華小兒外科雜志》、《中國實用兒科雜志》、《臨床小兒外科雜志》等雜志副總編、副主編單位及國內10余家雜志副總編和編委單位；是國家規劃教材《兒科學》第六版主編和第七、八版副主編單位；是統編教材《兒童保健學》第一版主編和第二、三版共同主編單位；是《小兒外科學》第四、五版和《兒科人文與醫患溝通》共同主編單位，《小兒傳染病學》第四版、《兒科雙語教材》、《兒科醫生實習手冊》副主編單位。是重慶市醫學會兒科專委會及小兒外科專委會、重慶市康復醫學會、重慶市營養學會婦幼營養專委會主任委員單位。